Field Detail

• mr

  private MolReader mr

• line

  private java.lang.String line

• userData

  private java.util.Map<java.lang.String,​java.lang.String[]> userData

Constructor Detail

• V3000Rdr

  public V3000Rdr()

Method Detail

• set

  V3000Rdr set​(AtomSetCollectionReader mr)

• readAtomsAndBonds

  void readAtomsAndBonds​(java.lang.String[] tokens)
                  throws java.lang.Exception

  Throws:

  java.lang.Exception

• readAtoms

  private void readAtoms​(int ac)
                  throws java.lang.Exception

  Throws:

  java.lang.Exception

• readBonds

  private void readBonds​(int bondCount)
                  throws java.lang.Exception

  Throws:

  java.lang.Exception

• readUserData

  private void readUserData​(int ac)
                     throws java.lang.Exception

  Throws:

  java.lang.Exception

• getField

  private java.lang.String getField​(java.lang.String key)

• rd

  private java.lang.String rd()
                       throws java.lang.Exception

  Throws:

  java.lang.Exception

• checkLineContinuation

  private void checkLineContinuation()
                              throws java.lang.Exception

  Throws:

  java.lang.Exception