Method Detail

• set

  JmolJDXMOLParser set​(JmolJDXMOLReader loader,
                       java.lang.String filePath,
                       java.util.Map<java.lang.String,​java.lang.Object> htParams)

• getRecord

  java.lang.String getRecord​(java.lang.String key)
                      throws java.lang.Exception

  Throws:

  java.lang.Exception

• getAttribute

  java.lang.String getAttribute​(java.lang.String line,
                                java.lang.String tag)

• readModels

  boolean readModels()
              throws java.lang.Exception

  Throws:

  java.lang.Exception

• readPeaks

  int readPeaks​(boolean isSignals,
                int peakCount)
         throws java.lang.Exception

  Throws:

  java.lang.Exception

• setLine

  void setLine​(java.lang.String s)

• readACDMolFile

  java.lang.String readACDMolFile()
                           throws java.lang.Exception

  Throws:

  java.lang.Exception

• readACDAssignments

  javajs.util.Lst<java.lang.String[]> readACDAssignments​(int nPoints,
                                                         boolean isPeakAssignment)
                                                  throws java.lang.Exception

  Throws:

  java.lang.Exception

• setACDAssignments

  int setACDAssignments​(java.lang.String model,
                        java.lang.String mytype,
                        int peakCount,
                        javajs.util.Lst<java.lang.String[]> acdlist,
                        java.lang.String molFile)
                 throws java.lang.Exception

  Throws:

  java.lang.Exception