Package org.jmol.api

Interface JmolPropertyManager

  • All Known Implementing Classes:
    PropertyManager
    public interface JmolPropertyManager

    • Method Summary

      All Methods Instance Methods Abstract Methods 
      Modifier and Type Method Description
      boolean checkPropertyParameter​(java.lang.String name)  
      java.lang.Object extractProperty​(java.lang.Object property, java.lang.Object args, int pt, javajs.util.Lst<java.lang.Object> v2, boolean isCompiled)  
      java.lang.String getAtomData​(java.lang.String atomExpression, java.lang.String type, boolean allTrajectories)  
      java.lang.String getChimeInfo​(int tok, BS selectionSet)  
      java.lang.String getDefaultPropertyParam​(int propertyID)  
      java.util.Map<java.lang.String,​java.lang.Object> getLigandInfo​(java.lang.Object atomExpression)  
      java.lang.String getModelCml​(BS bs, int nAtomsMax, boolean addBonds, boolean doTransform, boolean allTrajectories)  
      java.lang.String getModelExtract​(BS atomBitSet, boolean doTransform, boolean isModelKit, java.lang.String type, boolean allTrajectories)  
      java.lang.String getModelFileInfo​(BS visibleFramesBitSet)  
      java.util.Map<java.lang.String,​java.lang.Object> getModelInfo​(java.lang.Object atomExpression)  
      java.lang.String getPdbAtomData​(BS bs, javajs.util.OC out, boolean asPQR, boolean doTransform, boolean allTrajectories)  
      java.lang.String getPdbData​(int modelIndex, java.lang.String type, BS bsA, java.lang.Object[] parameters, javajs.util.OC oc, boolean addStructure)  
      java.lang.Object getProperty​(java.lang.String returnType, java.lang.String infoType, java.lang.Object paramInfo)  
      int getPropertyNumber​(java.lang.String name)  
      void setViewer​(Viewer vwr)  

    • Method Detail

      • setViewer

        void setViewer​(Viewer vwr)

      • getProperty

        java.lang.Object getProperty​(java.lang.String returnType,
                             java.lang.String infoType,
                             java.lang.Object paramInfo)

      • getDefaultPropertyParam

        java.lang.String getDefaultPropertyParam​(int propertyID)

      • getPropertyNumber

        int getPropertyNumber​(java.lang.String name)

      • checkPropertyParameter

        boolean checkPropertyParameter​(java.lang.String name)

      • extractProperty

        java.lang.Object extractProperty​(java.lang.Object property,
                                 java.lang.Object args,
                                 int pt,
                                 javajs.util.Lst<java.lang.Object> v2,
                                 boolean isCompiled)

      • getModelInfo

        java.util.Map<java.lang.String,​java.lang.Object> getModelInfo​(java.lang.Object atomExpression)

      • getLigandInfo

        java.util.Map<java.lang.String,​java.lang.Object> getLigandInfo​(java.lang.Object atomExpression)

      • getModelFileInfo

        java.lang.String getModelFileInfo​(BS visibleFramesBitSet)

      • getChimeInfo

        java.lang.String getChimeInfo​(int tok,
                              BS selectionSet)

      • getModelExtract

        java.lang.String getModelExtract​(BS atomBitSet,
                                 boolean doTransform,
                                 boolean isModelKit,
                                 java.lang.String type,
                                 boolean allTrajectories)

      • getPdbAtomData

        java.lang.String getPdbAtomData​(BS bs,
                                javajs.util.OC out,
                                boolean asPQR,
                                boolean doTransform,
                                boolean allTrajectories)

      • getPdbData

        java.lang.String getPdbData​(int modelIndex,
                            java.lang.String type,
                            BS bsA,
                            java.lang.Object[] parameters,
                            javajs.util.OC oc,
                            boolean addStructure)

      • getModelCml

        java.lang.String getModelCml​(BS bs,
                             int nAtomsMax,
                             boolean addBonds,
                             boolean doTransform,
                             boolean allTrajectories)

      • getAtomData

        java.lang.String getAtomData​(java.lang.String atomExpression,
                             java.lang.String type,
                             boolean allTrajectories)